MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018183	CAGG	2	8	51	58	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018183	CGT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018183	TGA	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018183	CGG	2	6	174	179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018183	GAA	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018183	TCC	2	6	1463	1468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_018183	AGG	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018183	ACC	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_018183	TCGT	2	8	1658	1665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018183	TGG	2	6	2324	2329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018183	TGAG	2	8	2352	2359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018183	ATTG	2	8	2644	2651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018183	GGT	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018183	GCT	2	6	2695	2700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018183	TCAA	2	8	2720	2727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018183	CAG	2	6	2915	2920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018183	CGC	2	6	2934	2939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018183	CAC	2	6	8994	8999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018183	TCC	2	6	9031	9036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018183	CCG	2	6	9075	9080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018183	GC	3	6	9104	9109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018183	TCGCCA	2	12	9110	9121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018183	GGC	2	6	9145	9150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018183	CTGG	2	8	9160	9167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018183	AGC	2	6	9173	9178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018183	CGG	2	6	9180	9185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018183	GCAC	2	8	9270	9277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018183	GGT	2	6	9283	9288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018183	ACG	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018183	TGGC	2	8	10644	10651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018183	GCC	2	6	10687	10692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018183	GCA	2	6	10704	10709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018183	AG	3	6	10729	10734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018183	GCT	2	6	10747	10752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018183	CAT	2	6	10758	10763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018183	CG	3	6	10788	10793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018183	GTCG	2	8	10853	10860	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018183	GGA	2	6	10943	10948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018183	TGGA	2	8	11002	11009	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.